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Unité Mixte de Recherche Inra-Univ. Bordeaux "Biodiversité Gènes et Communautés" - Biogeco

Unité mixte de recherche (Inra, Univ. Bordeaux 1) Biodiversité, gènes et communautés (Biogeco)

INRA_rvb150  

INRA Bordeaux-Aquitaine
Site de Recherches Forêt-Bois
69 route d'Arcachon
33612 CESTAS Cedex - FRANCE

Lagane Frédéric (Technicien)

05 35 38 53 56, frederic.lagane_at_inra.fr

lagane

Equipe Ecologie et Génomique Fonctionnelles - Plateforme GénoBois

Frédéric LAGANE

UMR 1202 Biodiversité Gènes & Communautés
INRA
69 route d'Arcachon
33610 CESTAS – France

Tel : 05 35 38 53 56
Fax: 05 57 12 28 81

Courriel : frederic.lagane_at_inra.fr

Formation

Brevet de Technicien Agricole Option Production Forestière (19- Meymac)

Activités de recherches

Si l’objectif premier du programme d’amélioration du Pin maritime (aujourd’hui fédéré en grande partie au sein d’un GIS) reste l’augmentation du volume de bois et de la forme du tronc à la coupe rase, les efforts s’orientent aujourd’hui vers d’autres critères de sélection parmi lesquels la qualité du bois tient une place essentielle. L’amélioration de la qualité du bois du pin maritime constitue un enjeu stratégique majeur de la filière forêt-bois-papier en Aquitaine, qui conditionnera à l’avenir son développement durable.

Si la croissance en hauteur et la rectitude basale du tronc peuvent se mesurer directement sur le terrain, l’évaluation de la qualité du bois passe par des mesures fines en laboratoire. Depuis une dizaine d’années, les chercheurs de l’INRA, du CIRAD, de l’Université de Bordeaux et du FCBA mettent au point de méthodes rapides d’évaluation directe ou indirecte de la qualité du bois. Bon nombre de ces méthodes peuvent d’ores et déjà être appliquées en routine sur de grands effectifs, une condition sine qua non à l’introduction de caractères de qualité dans un schéma d’amélioration génétique.

Dans ce cadre, l’un des objectifs du plateau GénoBois est de mettre à la disposition des améliorateurs et des chercheurs une chaîne d’analyse à haut débit permettant le phénotypage de propriétés fondamentales telles que la composition chimique, la densité, la rigidité du bois. Ce plateau se veut flexible et évolutif de façon à permettre l'intégration de nouvelles technologies. Je suis actuellement l'un des responsables techniques de ce plateau.

Publications récentes choisies

Prida A, Boulet J-C, Ducousso A, Nepveu G, Puech JL (2006) Effect of species and ecological conditions on ellagitannin content in oak wood from an even-aged and mixed stand of Quercus robur L. and Quercus petraea Liebl. Annals of Forest Science, 63, 415-424.
Prida A, Ducousso A, Petit RJ, Nepveu G, Puech JL (2007) Variation in wood volatile compounds in a mixed oak stand: strong species and spatial differentiation in whisky-lactone content. Annals of Forest Science, 64, 313-320
Pot D, Rodrigues J-C, Rozenberg P, Chantre G, Tibbits J, Cahalan C, Pichavant F, Plomion C (2006). QTLs and candidate genes for wood properties in maritime pine (/Pinus pinaster/ Ait.) _TGG_ 2 : 10-24
Pot D, Chantre G, Rozenberg P, Rodrigues JC, JG Lloyd, Pereira H, Hannrup B, Cahalan C, Plomion C (2002) Genetic control of pulp and timber properties in maritime pine (/Pinus pinaster/ Ait.). _Ann For Sci_ 59 : 563-575
Da Silva Perrez D, Guillemain A, A1azard P, Plomion C, Rozenberg P, Rodrigues JC, Alves A, Chantre G (2007) Improvement of /Pinus pinaster/ Ait elite trees selection by combining near infra red spectroscopy and genetic tools. _Holzforschung_ 61: 611 622
Can wood density be efficiently selected at early stage in maritime pine (/Pinus pinaster/ Ait.)? (2008) L. Bouffier, C. Charlot, A. Raffin, P. Rozenberg, A. Kremer. Ann For Sci 65, 106.

Publications orales et posters

15th international conference of the Plant Genome, San Diego, CA, 13-18 janvier 2007/
Lepoittevin C, /Cancino L, Bouffier L, Eveno E, Audigeos D, Paiva J, Garnier-Géré P, Léger V, Raffin A, Herrera R, Derory J, da Silva Perez D, Alazard P, Harvengt L/, //_Plomion C_/ (2007) Linking gene polymorphism to wood property variation in maritime pine. (P)
9th European Workshop on Lignocellulosic and Pulp (EWLP), Vienne, Autriche, 27-30 Août 2006/*//*
Silva-Perez D/, Guillemain A, Harvengt L, Plomion C, Rodrigues J, Chantre G. 2006. /Improvement of wood elite trees selection by combining near infrared spectroscopy and genetic tools/. *(C)*

Autres publications choisies récentes

Articles techniques :

- Lagane F., Danjon F., 2002 : Réalisation d’un chariot de saisie informatique. Le Cahier des Techniques n° 47,
- Lagane F., 2001 : La numérisation 3D. Adaptation d’un pointeur pour la mesure des racines. Le Cahier des Techniques n° 46, 3-4.

Rapports techniques :

- Danjon F., Courdier F., Lagane F., Drexhage M., Di Iorio A., Issenhuth B., Carnus T., 2000 : Measurement of root architecture by 3D digitizing, manuel technique, 16p
- Meredieu C., Cabanettes A., Trichet P., Lagane F., 1993: Installation de parcelles agroforestières : Croissance du chêne rouge d'Amérique (Quercus rubra L.) en relation avec un enherbement spontané. Rapport du projet CEE ALWAYS, 22pp.

Poster :

-Stefanie Wagner1,2, Frédéric Lagane1,2, Émilie Chancerel1,2, Andaine Seguin-Orlando3, Yves Billaud4,5, Willy Tegel6, Christophe Plomion1,2, Ludovic Orlando3, Antoine Kremer1,2., 2015. Waterlogged Wood Provides New Source for Tree Ancient DNA 1INRA, UMR1202, BIOGECO, F-33610 Cestas, France, 2Univ. Bordeaux, BIOGECO, UMR1202, F-33170 Talence, France, 3Centre for GeoGenetics, Natural History Museum of Denmark, University of Copenhagen, 1350 Copenhagen, Denmark, 4MCC/DRASSM, 13016 Marseille, France, 5UMR5204, Edytem, Univ. Savoie, 73376 Le Bourget-du-Lac, France 6Institute for Forest Growth IWW, University of Freiburg, 79106 Freiburg, Germany

- Espagnet C., Danjon F., Fourcaud T., Lagane F., Stokes A., 2001: 8th EFI conference "Risk and sustainable management", 8 september 2001, Bordeaux. Forest damage after the 1999 storm. Comparison of stem wood properties and root architecture between uprooted and standing mature Maritime pines trees.

 - Bert. D ., Lagane F ., Bouffier L ., Lepoitevin C , 2008. Prélèvement, préparation et stockage des échantillons, Poster

- Bert. D ., Lagane F ., Bouffier L , 2008. Mesure de la densité du bois par rayons X., Poster

- Danjon F., Pagès L., Descorps M.C., 2006. Root diameter as predictor of born root volume – estimating the missing root characteristics in Pinus pinaster (Ait) root systems. In: Proceedings COST 38 Meeting, Sede Boger, Israël, 4-8 February 2006, 1 p., poster.

- Danjon F., Bert D., Porte A., Meredieu C., Trichet P., Lagane F., Issenhuth B., 2007 ; Effect of fertilisation on 3D root architecture in 12-years-old Pinus pinaster trees. BANGOR

 - Porté A., Dulhoste R., Lopez S., Bosc A., Meredieu C., Teissier du Cros R., Trichet P., Bernier F., Loustau D. 2005 : Détermination de la biomasse aérienne du sous-bois de peuplements adultes de Pin maritime : contribution à la quantification des stocks de carbone forestier à l'aide d'indicateurs de couvert

- Danjon F., Pagès L., Descorps MC., Root diameter as predictor of borne root Volume. Estimating the missing root characteristics in Pinus pinaster (Ait) root systems. COST E38 meeting Sede Boqer, Israël 4-8 february 2006.

Participation à l’enseignement :

- ENITA de Bordeaux, 1ère année, Cycle de cours sur les enjeux scientifiques de l’étude intégrée du fonctionnement des peuplements végétaux- méthodes et outils. Visite et TD sur le site d’optimisation de la production forestière de l’Hermitage, le 01/07/2004, 3h

- Ecole primaire du Teich : Journée de sensibilisation à la forêt, dans le cadre du projet CPFA-Maison de la Forêt « fertilisation raisonnée du Pin maritime », 24 novembre 1997.

Communication orale / séminaire français :

- Danjon F., Stokes A., Khuder H., Lagane F., Bert D., Fourcaud T., Eveno E. Garnier-Géré P. 2008 Effet des stimulations mécaniques et/ou de géométrie du sol sur la plasticité de l'architecture des racines de structure. Séminaire "la plasticité phénotypique des arbres", Groupe d'Etude de l'Arbre, Montpellier, 2-3 octobre, p 15 (oral presentation + abstract in conference book).

Cité en remerciements pour collaboration technique ou co-auteur dans les articles suivants :

 Articles récents à Génobois:

Lamy JB, Lagane F, Plomion C, Cochard H, Delzon S (2012) Micro-evolutionary patterns of juvenile wood density in a pine species. Plant Ecology 213, 1781-1792.

Nanayakkara B, Lagane F, P Hodgkiss, M Dibley, S Smaill, M Riddell, Harrington J, Cown D (2013) Effects of induced drought and tilting on biomass allocation, wood properties, compression wood formation and chemical composition of young Pinus radiata genotypes (clones). Holzforschung

Cité en remerciements pour collaboration Technique dans les articles suivants

Equipe de Croissance et Production:

- Danjon F., Bert D., Godin C., Trichet P., 1999: Structural root architecture of 5-year-old of maritime Pine (Pinus pinaster Aït.) measured by 3D digitising and analysed with AMAPmod. Plant and Soil 217: 49-63.
- Cabanettes A., Courdier F., Meredieu C., Trichet P., 1995: Facteur et expression du polycyclisme juvénile chez le chêne rouge d'amérique planté en conditions naturelles. Annales des Sciences Forestières, 52, 489-506.
- Danjon F., 1995: Observed selection effects on height growth, diameter and stem form in maritime pine. Silvae Genet., 44(1), 10-19.
- Danjon F., 1994: Heritabilities and genetic correlations for estimated growth curves parameters in maritime pine. Theor. Appl. Genet., 89,911-921.
- Danjon F., 1994: Stand features and height growth in a 36-year-old maritime pine (Pinus pinaster Ait.) provenance test. Silvae Genet., 43, 53-62.

Equipe d’Ecophysiologie et Nutrition:

- Hayfa Khuder., Stokes A., Danjon F., Gouskou K., Lagane F., 2007. Is it possible to manipulate root anchorage in young trees? Plant Soil DOI 10.1007/s11104-007-9232-6

- Danjon F., Lagane F., Bakker M., 2006. L'architecture des racines de structure. Monographie

- Heuret P., Meredieu C., Coudurier T., Courdier F., Daniel Barthelemy., 2006. Ontogenetic trends in the morphological features of main stem annual shoots of pinus pinaster (pinaceae).American journal of botany 93(11): 1577–1587

- Bert D., Danjon F., 2006. Carbon concentration variations in the roots stem and crown of mature Pinus pinaster (Ait). Forest Ecology and Management, 222: 279-295.

- Augusto L., Meredieu C., Bert D., Trichet P., Porté A., Bosc A., Lagane F., Loustau D., Pellerin S., Danjon F., Anger J., Gelpe J.: Annals of Forest Science, 2005: Improving models of forest nutrient export with equations that predict the nutrient concentration of tree compartments.

- Augusto L., Bert D., 2005. Estimating stemwood nutrient concentration with an increment borer: a potential source of error. Forestry, 78: 451-455.
- Dupuy L., Fourcaud T., Stokes A., Danjon F., 2005. A density-based approach for the modelling of root architecture: application to Maritime pine (Pinus pinaster Ait.) root systems. Journal of Theoretical Biology, 236: 323-334.

- Danjon F., Fourcaud T., Bert D., 2005. Root architecture and windfirmness of mature Pinus pinaster Ait. New Phytologist, 168: 387-400. doi: 10.1111/j.1469-8137.2005.01497.x.

- Bert D., Danjon F., 2005. La teneur en carbone dans le Pin maritime. Mesure, variation, interprétation et utilisation pour estimer le stock de carbone des peuplements landais. In: VIIIème colloque ARBORA, "CARBONE, FORET, BOIS : Impacts du changement climatique, stratégies pour la filière ?", ISTAB, Bordeaux, 1-2 décembre 2005, 187-208.

- Porté A., Dulhoste R., Lopez S., Bosc A., Meredieu C., Teissier Du Cros R., Trichet P., Bernier F., Loustau D., 2005. Détermination de la biomasse aérienne du sous-bois de peuplements adultes de Pin maritime : contribution à la quantification des stocks de carbone forestier à l'aide d'indicateurs de couvert. In: VIIIème colloque ARBORA, "CARBONE, FORET, BOIS : impacts du changement climatique, stratégies pour la filière ?", ISTAB, Bordeaux, 1-2 décembre 2005, 97-107.

- Porté A., Trichet P., Bert D., Loustau D., 2002: Allometric relationships for branch and tree woody biomass of Maritime pine (Pinus pinaster Aït.) Forest Ecology and Management 158, 1-3, 71-83.

- Porté A., Loustau D., 2001: Seasonal and inter-annual variations in carbon isotope discrimination in a maritime pine (Pinus pinaster Aït.) stand assessed from the isotopic composition of the cellulose of annual rings. Tree Physiol. 21(18-19): 861-868.
- Porté A., Bosc A., Champion I., Loustau D., 2000: Estimating the foliage biomass and area of maritime Pine (Pinus pinaster Aït.) branches and crowns with application to modelling the foliage area distribution in the crown. Ann. For. Sci. 57 (1): 73-86.
- Porté A., 1999 : Modélisation des effets du bilan hydrique sur la production primaire et la croissance d'un couvert de Pin maritime (Pinus pinaster Aït.) en Lande Humide. Thèse de Docteur en Sciences, option Ecologie générale, de l'Université d'Orsay – Paris XI. 172 p + annexes.

- Trichet P., Vauchel V., Bert D., Bonneau M., 1999 : Fertilisation initiale et réitérée du Pin maritime (Pinus pinaster Aït) : Principaux résultats de l'essai de Berganton. Revue Forestière Française, LII, 3, 207-222.

Equipe d’Amélioration Génétique :

- Ducousso A., Bacilieri R., Demesure B., Dumoulin-Lapègue S., Kremer A., Petit R., Zanetto A., 1997 : Structuration géographique de la diversité génétique chez les chênes à feuilles caduques européens. ONF- Bulletin Technique n°33.
- Ducousso A., Bodénès C., Petit R., Kremer A., 1996 : Le point sur les chênes blancs européens. Forêt-entreprise n°111.
- Ducousso A., Guyon JP., Krémer A., 1996 : Latitudinal and altitudinal variation of bud burst in western populations of sessile oak (Quercus petraea (Matt) Liebl) Annales Sciences Forestières 53, 775-782.
- Ducousso A., Petit R., 1995 : Le geai des chênes, premier reboiseur européen. Forêt entreprise n°97,60-64.

-Bouffier L., Raffin A., Rozenberg P., Meredieu C., Kremer A., 2009 : What are the consequences of growth selection on wood density in French maritime pine breeding programme ? Tree Genetics et Genomes 5:11-25 

-Jean-Baptiste Lamy1,2,3, Frédéric Lagane1,2, Christophe Plomion1,2, Hervé Cochard3, Sylvain Delzon1,2., 2012: The evolutionary stasis of wood density in a Pinus species 

-JB Lamy, F Lagane, C Plomion, H Cochard, S Delzon : Micro-evolutionary patterns of juvenile wood density in a pine species; Plant Ecology, 2012 - Springer

-Bernadette Nanayakkara, Frederic Lagane, Jonathan Harrington and Dave Cown ,2012: Effects of mechanical and drought stress on biomass allocation, wood properties, compression wood formation and chemistry of 2-year old Pinus radiata genotypes 

-Bernadette Nanayakkara, Frederic Lagane, Pat Hodgkiss, Mike Dibley, Simeon Smaill, Mark Riddell, Jonathan Harrington and Dave Cown:  Response of pine genotypes to drought and tilting Effects of induced drought and tilting on biomass allocation, wood properties, compression wood formation and chemical composition of young Pinus radiata genotypes (clones).  Holzforschung. Volume 68, Issue 4, Pages 455–465, ISSN (Online) 1437-434X, ISSN (Print) 0018-3830, DOI: https://doi.org/10.1515/hf-2013-0053, November 2013

-Elisa Marguerit  Laurent Bouffier  Emilie Chancerel  Paolo Costa  Frédéric Lagane Jean-Marc Guehl  Christophe Plomion  Oliver Brendel : The genetics of water-use efficiency and its relation to growth in maritime pine ; J Exp Bot (2014) 65 (17): 4757-4768. DOI: https://doi.org/10.1093/jxb/eru226 Published: 01 July 2014

Autres :

- Pegoraro E., 1997 : Etude expérimentale de l’architecture et de la biomasse aérienne et participation à l’étude biomécanique de l’ancrage racinaire d’un jeune peuplement de Pin maritime dans les Landes de Gascogne. Rapport de stage technique et applicatif. Università degli studi della Tuscia, Viterbo, Italia. 35 pp.
- Champion I., Porté A., Bert D., Loustau D., Guedon M., Courdier F., Lagane F., Lambrot C., Lardit A., Sartore M., 2001: Tree architecture in remote sensing analytical models: The Bray experiment. International Journal of Remote Sensing Vol. 22, No. 9, 1827-1843.

Cité en remerciement dans les Rapports techniques suivants :

Maximilian Larter , Sebastian Pfautsch , Jean-Christophe Domec, Santiago Trueba5, Nathalie Nagalingum and Sylvain Delzon : Aridity drove the evolution of extreme embolism resistance and the radiation of conifer genus Callitris New Phytologist (2017) doi: 10.1111/nph.14545

-Copyright FCBA INFO, Février 2010 : Les biotechnologies bientôt au service de la sélection du pin maritime assistée par marqueur moléculaire

- Gelin M., 2004. Caractérisation et dynamique temporelle de la structure spatiale du peuplement de pins maritimes du site atelier du Bray. Mémoire de stage IUP Environnement, Géo-ingénierie et Développement 2ème année, Institut EGID Bordeaux 3, 46 p. + annexes.
- Lopez S., 2004 - 2005. Suivi comparé de la biomasse et de l’indice foliaire de la végétation herbacée de cultures et forêts du Sud-Ouest. Implication pour le flux net de carbone dans le cadre du projet CARBOEUROPE. Rapport de stage UFR Sciences Biologiques, Master 1 Sciences et technologies, UniversitéBordeaux 1, 17 p. + annexes.

Cité en remerciement dans les Posters suivants:

- Bert. D , Lagane F , Bouffier L , Lepoitevin C , 2008. Prélèvement, préparation et stockage des échantillons, Poster
- Bert. D , Lagane F , Bouffier L , 2008. Mesure de la microdensité du bois par rayons X., Poster
- Danjon F., Pagès L., Descorps M.C., 2006. Root diameter as predictor of born root volume – estimating the missing root characteristics in Pinus pinaster (Ait) root systems. In: Proceedings COST 38 Meeting, Sede Boger, Israël, 4-8 February 2006, 1 p., poster.
- Danjon F., Bert D., Porte A., Meredieu C., Trichet P., Lagane F., Issenhuth B., 2007 ; Effect of fertilisation on 3D root architecture in 12-years-old Pinus pinaster trees. BANGOR

Ayant participé à la récolte des données :

- Trichet P., Loustau D., Pastuzska P., Lesgourgues Y., Merzeau D., Linder S., 2005. Fixation nette de carbone dans la biomasse d'un peuplement de Pin maritime dans les Landes de Gascogne. In: VIIIème colloque ARBORA, "CARBONE, FORET, BOIS : Impacts du changement climatique, stratégies pour la filière ?", ISTAB, Bordeaux, 1-2 décembre 2005, 91-95.
- Meredieu C., Colin A., Teissier Du Cros T., Porté A., Loustau D., 2005. Evaluation des stocks de carbone dans la biomasse de peuplements de Pin maritime : application à l'échelle régionale. In: VIIIème colloque ARBORA, "CARBONE, FORET, BOIS : Impacts du changement climatique, stratégies pour la filière ?", ISTAB, Bordeaux, 1-2 décembre 2005, 143-159.