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UMR 1332 Biologie du Fruit et Pathologie

Virginie Garcia

Bioinformatique de l'équipe Génomique Fonctionnelle du développement du Fruit

Responsable de la bioinformatique de la plateforme Génome-Transcriptome du CGFB

 

CV :

  • Date de naissance : 08/05/1975
  • Diplômes : DESS Informatique des Systèmes Complexes

 

CONTACTS

Tél. 0557122388 

 

RATTACHEMENT : Equipe Génomique Fonctionnelle du Développement du Fruit

 

THEMES DE RECHERCHE :

Profilage transcriptomique, Intégration de données, Analyse de polymorphisme

 

PUBLICATIONS :

Genotype-dependent response to carbon availability in growing tomato fruit. Prudent M, Bertin N, Génard M, Muños S, Rolland S, Garcia V, Petit J, Baldet P, Rothan C, Causse M. Plant Cell Environ. 2010 Jul;33(7):1186-204.

An integrative genomics approach for deciphering the complex interactions between ascorbate metabolism and fruit growth and composition in tomato. Garcia V, Stevens R, Gil L, Gilbert L, Gest N, Petit J, Faurobert M, Maucourt M, Deborde C, Moing A, Poessel JL, Jacob D, Bouchet JP, Giraudel JL, Gouble B, Page D, Alhagdow M, Massot C, Gautier H, Lemaire-Chamley M, de Daruvar A, Rolin D, Usadel B, Lahaye M, Causse M, Baldet P, Rothan C. C R Biol. 2009 Nov;332(11):1007-21.

Gene and metabolite regulatory network analysis of early developing fruit tissues highlights new candidate genes for the control of tomato fruit composition and development. Mounet F, Moing A, Garcia V, Petit J, Maucourt M, Deborde C, Bernillon S, Le Gall G, Colquhoun I, Defernez M, Giraudel JL, Rolin D, Rothan C, Lemaire-Chamley M. Plant Physiol. 2009 Mar;149(3):1505-28.

GDP-D-mannose 3,5-epimerase (GME) plays a key role at the intersection of ascorbate and non-cellulosic cell-wall biosynthesis in tomato. Gilbert L, Alhagdow M, Nunes-Nesi A, Quemener B, Guillon F, Bouchet B, Faurobert M, Gouble B, Page D, Garcia V, Petit J, Stevens R, Causse M, Fernie AR, Lahaye M, Rothan C, Baldet P. Plant J. 2009 Nov;60(3):499-508.

Silencing of the mitochondrial ascorbate synthesizing enzyme L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase affects plant and fruit development in tomato. Alhagdow M, Mounet F, Gilbert L, Nunes-Nesi A, Garcia V, Just D, Petit J, Beauvoit B, Fernie AR, Rothan C, Baldet P. Plant Physiol. 2007 Dec;145(4):1408-22.