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UMR 1332 Biologie du Fruit et Pathologie

Sophie Colombié (Dr)

Chercheur
CV :

Diplômes : Docteur en Génie des Procédés, Ecole Nationale Supérieure des Mines de Paris (ENSMP). DEA (Biotechnologie). Ingénieur en Génie Biochimique et Alimentaire. Institut National des Sciences Appliquées (INSA) Toulouse.

Parcours : Suite à une formation en Biotechnologies appliquées et un début de carrière à  l’INRA de Montpellier (2000-2006) sur la thématique  du contrôle des fermentations œnologiques, je m’intéresse maintenant à la modélisation du métabolisme central et à l’analyse des flux métaboliques des cellules végétales.

 

CONTACTS :

Sophie Colombié

UMR 1332 Biologie du Fruit et Pathologie 

INRA BP 81

33883 VILLENAVE D'ORNON Cedex

tel: (33)5 57 12 25 77 

fax: (33)5 57 12 25 41

e-mail: sophie.colombie@bordeaux.inra.fr

 

THEMES DE RECHERCHE :

Au sein du groupe «Métabolisme du fruit », je travaille sur l’analyse et la modélisation des flux métaboliques des cellules végétales, en collaboration avec des mathématiciens. Mon activité principale consiste à déterminer et analyser les flux métaboliques du métabolisme central de cellules hétérotrophes. Notre modèle biologique principal au laboratoire est le fruit de tomate, modèle de fruit charnu. Nous nous intéressons en particulier aux modifications métaboliques majeures au cours du développement du fruit.

PUBLICATIONS :

Bénard C, Bernillon S, Biais B, Osorio S, Maucourt M, Ballias P, Deborde C, Colombié S, Cabasson C, Jacob D, Vercambre G, Gautier H, Rolin D, Génard M, Fernie AR, Gibon Y, Moing A. (2015) Metabolomic profiling in tomato reveals diel compositional changes in fruit affected by source–sink relationships. Journal of Experimental Botany, 66 (11): 3391–3404.

Colombié S, Nazaret C,  Bénard C, Biais B, Mengin V, Solé M, Fouillen L, Dieuaide-Noubhani M, Mazat J-P, Beauvoit B and Gibon Y (2015) Modelling central metabolic fluxes by constraint-based optimization reveals metabolic reprogramming of developing Solanum lycopersicum (tomato) fruit The Plant Journal 81, 24:39.

Beauvoit B, Colombié S, Monier A, Andrieu MH, Biais B, Benard C, Cheniclet C, Dieuaide-Noubhani M, Nazaret C, Mazat JP, Gibon, Y (2014) Model-Assisted Analysis of Sugar Metabolism throughout Tomato Fruit Development Reveals Enzyme and Carrier Properties in Relation to Vacuole Expansion. Plant Cell 26(8) 3224-3242.

Biais B, Bénard C, Beauvoit B, Colombié S, Prodhomme D, Ménard G, Bernillon S, Gehl B, Gautier H, Ballias P, Mazat J-P, Sweetlove L, Génard M & Gibon Y (2014) Remarkable reproducibility of enzyme activity profiles in tomato fruits grown under contrasting environments provides a roadmap for studies of fruit metabolism. Plant Physiology 164: 1204–1221.

Beurton-Aimar, M., Beauvoit, B., Monier, A., Vallée, F., Dieuaide-Noubhani, M., Colombié, S. (2011). Comparison between elementary flux modes analysis and 13C-metabolic fluxes measured in bacterial and plant cells. BMC Systems Biology, 5.