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St Pee

Aquapôle INRA

Inra Bordeaux-Aquitaine
Quartier Ibarron
64310 Saint-Pée-sur-Nivelle
FRANCE

tél : +33 (0) 5 59 51 59 51
fax : +33 (0) 5 59 54 51 52

Jacques Labonne

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Jacques Labonne
Comment modéliser l'individu et son comportement dans le fonctionnement des populations naturelles ? Cette question implique tout d'abord un challenge technique, à savoir développer des approches diverses en modélisation qui permettent une représentation non simpliste des comportements individuels. Dans un deuxième temps, les progrès réalisés dans cette modélisation permettront de mieux comprendre l'influence de la variabilité individuelle (comportementale ou phénotypique) dans le fonctionnement des populations.

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Coordonnées

UMR ECOBIOP
Aquapole - INRA
Quartier Ibarron
64310 Saint-Pée sur Nivelle – France
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Fax: 05 59 54 51 52
e-mail : prénom.nom@inra.fr

Activités

Cursus et formation
Doctorat réalisé à l’Université Claude Bernard de Lyon 1, sur la Biologie de la Conservation d’un percidé endémique au bassin du Rhône, l'Apron (Zingel asper). Le document de thèse est accessible ici , et pour en savoir plus sur l'Apron du Rhone, c'est et .
J’ai ensuite effectué un post-doctorat de 3 ans financé par GAVRNA. Le sujet portait sur le rôle de la fragmentation dans le fonctionnement des populations de truite fario (Salmo trutta) en Navarre, Espagne.

Thématiques actuelles
Mes thématiques de recherches actuelles sont globalement rassemblées autour d’une question unique : comment modéliser l’individu et son comportement dans le fonctionnement des populations naturelles ? Cette question implique tout d’abord un challenge technique, à savoir développer des approches diverses en modélisation qui permettent une représentation non simpliste des comportements individuels. Dans un deuxième temps, les progrès réalisés dans cette modélisation permettront de mieux comprendre l’influence de la variabilité individuelle (comportementale ou phénotypique) dans le fonctionnement des populations.
J'applique actuellement cette approche à deux domaines connexes: la sélection sexuelle, et l'adaptation locale.

Vous pouvez retrouver tout cela en détail sur le blog Fish&Bits, un endroit où les chercheurs et étudiants de mon laboratoire expliquent et illustrent leur travaux de recherche.

 

Partenariats en cours

 

  • Le projet SALMEVOL-2 est en cours (2014-2018), animé par Philippe Gaudin. Son objectif reste l'étude de l'écologie évolutive des salmonidés  au cours de la colonisation. Il est financé par l'Institut Polaire (IPEV) et l'INRA. Le rapport final du projet SALMEVOL-1 (2008-2012) est disponible ici.
  • La thèse de Zoé Gauthey est terminée ! Vous trouverez son manuscrit ici, et ses publications ci-dessous.
  • La thèse de Jordi Gil est terminée ! Vous trouverez son manuscrit ici, et ses publications ci-dessous.
  • Collaboration technique:
     Mes travaux de modélisation s'inscrivent dans le cadre de la communauté Capsis-4, en collaboration avec François de Coligny, de l'UMR INRA AMAP. Un peu d'informations sur la plateforme Capsis-4 : http://coligny.free.fr

 

Publications récentes

 

  • Gauthey, Z., Hendry A.P., Elosegi, A., Tentelier, C., Labonne, J. (2016). The context dependence of assortative mating illustrated with conspecific salmonid populations. Journal of Evolutionary Biology, DOI: 10.1111/jeb.12914.
  • Labonne, J., Kaeuffer, R., Guéraud, F., Zhou, M., Manicki, A., Hendry, A.P. (2016). From the bare minimum: genetics and selection in populations founded by one female. Evolutionary Ecology Research, 17:21-34.
  • Gil, J., Labonne, J., Caudron, A. (2016). Evaluation of strategies to conserve and restore intraspecific biodiversity of brown trout: outcomes from genetic monitoring in the French Alps. Reviews in Fish Biology and Fisheries. 26: 1-11.
  • Régnier, T., Labonne, J., Chat, J., Yano, A., Guiguen, Y., Bolliet, V. (2015). No gender effect on energetic status and early life history in brown trout (Salmo trutta). Royal Society Open Science, 2: 150441.
  • Gauthey, Z., Panserat, S., Elosegi, A., Herman, A., Tentelier, C., Labonne, J. (2016). Experimental evidence of population differences in reproductive investment conditional on environmental stochasticity. Science of the Total Environment,  541: 143-148.
  • Gauthey, Z., Lang, M., Elosegi, A., Tentelier, C., Rives, Labonne, J. (2015). Brown trout spawning habitat selection and its effects on egg survival. Ecology of Freshwater Fish, doi: 10.1111/eff.12262.
  • Gil J, Caudron A, Labonne J (2015) Can female preference drive intraspecific diversity dynamics in brown trout (Salmo trutta L.)? Ecology of Freshwater Fish. doi: 10.1111/eff.12215
  • Gauthey, Z., Freychet, M., Manicki, A., Herman, A., Lepais, O., Panserat, S., Elosegi, A., Tentelier, C., Labonne, J. 2015. The concentration of plasma metabolites varies throughout reproduction and affects offspring number in wild brown trout (Salmo trutta). Comparative Biochemistry and Physiology A Molecular and Integrative Physiology, 184: 90-96.
  • Teichert, N.; Valade, P.; Lim, P.; Dauba, F.; Labonne, J.; Richarson, M.; Bosc, P.; Gaudin, P.2014. Habitat selection in amphidromous Gobiidae of Reunion Island: Sicyopterus lagocephalus (Pallas, 1770) and Cotylopus acutipinnis (Guichenot, 1863). Environmental Biology of Fishes, 97:255-266.
  • Labonne, Jacques; Vignon, Matthias; Prevost, Etienne; et al.2013. Invasion dynamics of a fish-free landscape by brown trout (Salmo trutta). PLOS One 8: e71052.
  • Régnier, T., Bolliet V., Gaudin, P., and Labonne, J. 2013. Bigger is not always better: egg size influences survival throughout incubation in brown trout (Salmo trutta). Ecology of Freshwater Fish 22:169-177.
  • Régnier, T., Bolliet V., Gaudin, P., and Labonne, J. 2012. Female Effects on Offspring Energetic Status and Consequences on Early Development in Yolk Feeding Brown Trout (Salmo trutta) Journal of Experimental Zoology Part A - Ecological Genetics and Physiology 317A:347-358.
  • Labonne, J., Régnier, T., and Tentelier. 2012. Reproductive system in brown trout: ongoing evolution ? In : Trout: from physiology to conservation, Moon, T.W, and Polakof, S. Eds. Nova.
  • Régnier, T., Bolliet, V., Gaudin, P., and Labonne, J. 2012. Female effects on offspring energetic status and consequences on early development in yolk feeding brown trout (Salmo trutta). Journal of Experimental Zoology Part A, 317A:347-358.
  • Acolas, M. L., Labonne, J., Baglinières, J. L., and Roussel, J. M. 2012. The role of body size versus growth on the decision to migrate: a case study with Salmo trutta. Naturwissenschaften, 99:11-21.
  • Régnier, T., Labonne, J., Gaudin, P., and Bolliet, V. 2012. Influence of energetic status on ontogenetic niche shifts: emergence from the redd is linked to metabolic rate in brown trout. Oecologia 168:371-380.
  • Tentelier, C., Larrieu, M., Aymes, J.C., and Labonne, J. 2011. Male antagonistic behaviour after spawning suggest paternal care in brown trout (Salmo trutta). Ecology of freshwater fish (DOI: 10.1111/j.1600-0633.2011.00507.x).
  • Gaucherel, C. Salomon, L., and Labonne, J. 2011. Variable self-similar sinuosity properties within simulated networks. Earth Surface Processes and Landforms, 36:1313-1320.
  • Aymes, J.C., Larrieu, M., Tentelier, C. and Labonne, J. 2010. Occurrence and variation of egg cannibalism in brown trout, Salmo trutta. Naturwissenschaften, 97:435-439.
  • Labonne, J. and Hendry A.P. 2010.  Natural and sexual selection giveth and taketh away reproductive barriers: models of population divergence in guppies. American Naturalist, 176:26-39.
  • Imbert, H., Labonne, J., Rigaud, C. and Lambert, P. 2010. Resident and migratory tactics in freshwater European eels are size-dependent. Freswhater Biology, 55:1483-1493.
  • Régnier, T., Bolliet, V., Labonne, J., and Gaudin, P. 2010. Assessing maternal effects on metabolic rate dynamics along early development in brown trout (Salmo trutta): an individual-based approach. Journal of Comparative Physiology B., 180:25-31.
  • Labonne, J., Augéry, M., Parade, M., Brinkert, S., Prévost, E., Héland, M., and Beall, E. 2009. Female preference for male body size in brown trout (Salmo trutta): is big still fashionable ? Animal Behaviour, 77 : 129-137
  • Labonne, J.,  Ravigné, V., Parisi, B., and Gaucherel, C. 2008. Linking dendritic networks structure to population demogenetics : the downside of connectivity. Oikos, 117: 1479-1490
  • Bolliet, V. and Labonne, J. 2008. Individual patterns of rhythmic swimming activity in Anguilla anguilla glass eels synchronised to water current reversal. Journal of experimental marine Biology and Ecology, 362:125-130.