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Tél: (33) 05 57 12 26 40
Mail : carole.couture@inrae.fr

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Expérience professionnelle / Formation

• Depuis 2015 : Ingénieur Biologie HC - INRAE UMR 1065 SAVE – Bordeaux
• Sept 2011 à sept 2014 : Ingénieur Biologie IE1 Étudiante en Master 2 recherche Biologie et Biotechnologie des plantes puis en thèse (arrêtée en 2ème année)
• Avril 2006 à sept 2011 : Ingénieur Biologie IE2 INRA Bordeaux (Unité BFP)
• Février 2004 à mars 2006 : Ingénieur Biologie IE2 INRA Versailles (Unité PMDV – équipe MDO)

Activités de recherche

Les activités de recherche de Carole portent sur les bio-agresseurs du vignoble et principalement le mildiou qui est à l’origine de plus de 80% des produits phytosanitaires utilisés sur le vignoble. Elle fait partie de l'équipe « Gestion des résistances variétales », dans lequel elle est chargée d’organiser et de gérer les données acquises dans le cadre de nos travaux de génomique des populations de mildiou, afin de réaliser des analyses sur la diversité des populations. Dans ce cadre, Carole interagit avec les membres de l'équipe et aussi avec d’autres équipes INRAE, avec un rôle d’interlocutrice privilégiée auprès des plateformes de séquençage sur lesquels nos échantillons sont traités. Dans cette équipe elle réalise des analyses bioinformatiques en génomique du mildiou.

Carole fait également partie de l’axe 1 du CATI INRAE BARIC, Bioinformatique pour l’Analyse, la Représentation et Intégration de Connaissances, qui s’occupe de développer et déployer des protocoles de bioanalyse sur les e-infrastructures de l’INRAE pour l’Analyse et Intégration de données.

Elle est co-responsable de Données Opérationnelles (RDO) pour SAVE et assure la diffusion des bonnes pratiques de sauvegarde et de suivi des données.

Projets significatifs en cours

• Site internet https://grapevine-downy-mildew-genome.com/ (GDMG)
• Dataverse : https://entrepot.recherche.data.gouv.fr/dataverse/gdmg
• Nextcloud : https://nextcloud.inrae.fr/apps/files/?dir=/data-evohe&fileid=17998566

Publications :

Dussert Y., Mazet I.D., Couture C.,Gouzy J., Piron M.C., Rispe C., Mestre P., Delmotte F. (March 2019). A High-Quality Grapevine Downy Mildew Genome Assembly Reveals Rapidly Evolving and Lineage-Specific Putative Host Adaptation Genes. Genome Biology and Evolution 11(3):954-969 :https://doi.org/10.1093/gbe/evz048

Dussert Y., Mazet I.D., Couture C.,Gouzy J., Piron M.C., Rispe C., Mestre P., Delmotte F. (2018). High quality assembly of the grapevine downy mildew (Plasmopara viticola) genome reveals lineage-specific and fast-evolving genes potentially involved in host adaptation. March 2019, Genome Biology and Evolution 11(3):954-969 : https://doi.org/10.1093/gbe/evz048

Dussert Y, Legrand L, Mazet I, Couture C, Piron MC, Serre RF, Bouchez O, Mestre P, Toffolatti SL, Giraud T, Delmotte F (2020) Identification of the first Oomycete mating-type locus sequence in the grapevine downy mildew pathogen, Plasmopara viticola. Current Biology, 30, 3897-3907, https://doi.org/10.1016/j.cub.2020.07.057