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Unité Mixte de Recherche Inra-Univ. Bordeaux "Biodiversité Gènes et Communautés" - Biogeco

Unité mixte de recherche (Inra, Univ. Bordeaux 1) Biodiversité, gènes et communautés (Biogeco)

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INRA Bordeaux-Aquitaine
Site de Recherches Forêt-Bois
69 route d'Arcachon
33612 CESTAS Cedex - FRANCE

EVOLTREE

Evolution of Trees as drivers of Biodiversity

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2006-2010 Réseau d’excellence EVOLTREE financé par l’Union Européenne (FP6 N° 016322) « Évolution des arbres comme vecteurs de la biodiversité des écosystèmes terrestres ». Antoine Kremer, coordinateur. EVOLTREE est un réseau d’excellence mis en place dans le cadre du 6ième programme cadre européen et fédère 25 laboratoires issus de 15 Pays.

Comme tout réseau d’excellence, il a pour objectifs, de développer des recherches autour d’un thématique majeure, d’intégrer les moyens et ressources autour de cette thématique, et de disséminer les résultats dans la communauté scientifique et le grand public. En termes de recherches, le réseau d’excellence a pour ambition d’associer quatre disciplines complémentaires (écologie, évolution, génomique, génétique) pour prédire les réponses des espèces et des communautés aux changements environnementaux. Cette ambition passe par la description de la diversité génétique et interspécifique dans les écosystèmes terrestres et l’analyse des processus écologiques et génétiques qui contribuent à la dynamique de cette diversité. L’accent est particulièrement mis sur les arbres et leur diversité, comme vecteurs essentiels de la biodiversité dans les écosystèmes naturels et cultivés. Son originalité porte sur la prise en compte des interactions entre espèces en combinant les acquis le plus récents de la génomique et de l’écologie, pour promouvoir une nouvelle discipline « ecosystem genomics ».

Ce réseau européen fonctionne désormais par contribution volontaire de ses membres et est hébergé par l’EFI. Le réseau actuel regroupe 23 laboratoires issus de 13 pays, il est la continuation du réseau d’excellence EVOLTREE financé par l’Union Européenne de 2006 à 2010.

L’objectif principal du réseau est de promouvoir des recherches dans le domaine de la génomique environnementale en associant des approches complémentaires faisant appel à la génétique, la génomique, l’écologie et l’évolution et répondant à des préoccupations globales (biodiversité, changements climatiques). Dans cet esprit le réseau maintien et développe des ressources et infrastructures expérimentales mis en place durant la période de financement par de l’Union Européenne tels que le laboratoire virtuel eLab, le centre de ressources génomiques, des sites d’observation et de suivi. Il facilite aussi l’accès et l’utilisation à ces ressources. Le réseau organise également des écoles d’été et entretient un dialogue avec les utilisateurs des résultats de la recherche.

BIOGECO héberge et administre l’une des ressources développée par le réseau, le Portail Chêne, qui est la plateforme des données génomiques et génétiques des chênes et d’autres espèces appartenant aux Fagacées. Le portail donne accès à de nombreuses bases de données (cartes génétiques, librairies EST, diversité génétiques, marqueurs génétiques etc..). Il comprend également des pages d’information générales sur le genre Quercus.

Le portail chêne est connecté au laboratoire virtuel (eLab) d’EVOLTREE qui a été développé par Dieter Kopecky et Johanna Schmidt de AIT (Austrian Institute of Technology Gmbh). Il a été construit durant le financement du réseau EVOLTREE par l’Union Européenne et est aujourd’hui administré par François Ehrenmann.