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Unité Mixte de Recherche Inra-Univ. Bordeaux "Biodiversité Gènes et Communautés" - Biogeco

Unité mixte de recherche (Inra, Univ. Bordeaux 1) Biodiversité, gènes et communautés (Biogeco)

INRA_rvb150  

INRA Bordeaux-Aquitaine
Site de Recherches Forêt-Bois
69 route d'Arcachon
33612 CESTAS Cedex - FRANCE

GnpIS

GnpIS : système d’information pour gérer les données de génétiques et de génomiques du département EFPA

Portail : http://urgi.versailles.inra.fr/gnpis

Les travaux de recherche réalisés au sein du département EFPA s’appuient sur de nombreuses expérimentations (Placettes en milieu naturel, Site de suivi intensif, Tests sylvicoles, PlantaComp, Gradients altitudinaux, ...) et les expérimentations en génétique et génomique sur les arbres forestiers produisent un gros volume de données (phénotypiques, génomiques, génétiques, passeport, ...). De nombreux outils, avec différents objectifs et dans différents cadres, ont été développés, ce qui provoque une dispersion de l'information.

L'intérêt de mettre en place un outil central est donc apparu, et une réflexion menée dans le cadre de l'action PlantaComp 2010 a permis d'identifier les besoins et de réaliser une prospection des outils existants.

Qu’est ce que GnpIS ?

  • Système d’information
    • Pour les plantes et les bio-agresseurs
    • Données de génétique et de génomique, données phénotypiques
    • Gestion d’informations publiques et privées
    • Partenariats nationaux, internationaux et SI stratégique pour l'INRA
  • Evolution
    • Outils spécifiques et outils open source
    • Développements constants à l’URGI
    • Impact des projets et des utilisateurs
  • Recherche
    • Globale (Google like)
    • Par thématique
      • Phénotypage
      • Ressources génétiques
      • Généalogie des accessions
      • Interopérabilité (Quick search)
GnpIS

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