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L’équipe de Virologie est fortement impliquée dans le développement et l’utilisation de méthodes de détection et de caractérisation des virus associant séquençage haut débit d’acides nucléiques purifiés à partir d’extraits végétaux et analyse bioinformatique.

Dans le prolongement de cette activité scientifique, l'équipe a mis en place une plateforme qui offre aux partenaires de INRAE et aux acteurs de la filière agricole concernés par la santé des plantes l’accès à ces technologies fiables, sensibles et permettant pour la première fois la détection exhaustive de l’ensemble des agents viraux infectant un échantillon végétal. Cette plateforme est aujourd'hui le point d'entrée INRAE pour tous les partenaires (semenciers, instituts techniques, organisations de producteurs et prestataires de services de diagnostic) recherchant de telles analyses à la demande, notamment pour l'identification des virus impliqués dans de nouvelles maladies ou dans un syndrome d'étiologie inconnue.

Le plateau réalise à la demande l'analyse et le conseil sur un projet, la réception des échantillons végétaux puis l'extraction et l'amplification des acides nucléiques. Le séquençage haut débit est sous-traité à un prestataire externe et la plateforme réalise ensuite l'analyse bioinformatique des séquences générées, allant ainsi jusqu'à l'identification des virus connus ou nouveaux présents dans les échantillons analysés.