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UMR 1332 - Biologie du Fruit et Pathologie

UMR 1332 Biologie du Fruit et Pathologie

Dominique Rolin (Pr)

Dominique Rolin
Professeur de Biologie Végétale

Directeur du Centre de Génomique Fonctionnelle Bordeaux

Président du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique

CV :
  • Date de naissance : 11 Juillet 1958
  • Diplômes : HDR 2003 Université de Rennes, Thèse de l’Université de Rennes 1997

CV à télécharger

Parcours :  

1994-- :  Professeur à l’Université Bordeaux Segalen

1992-1994: Maître de Conférences à l'Université de Rennes I.

1991-1992: Ingénieur commercial pour SERONO (Société de diagnostic en biologie).

1987-1991: Chargé de recherche au United States Department of Agriculture, Plant and Soil Biophysics Unit. (Philadelphie, USA).

1984-1987: Chercheur contractuel du Ministère de l'Industrie et de la Recherche à l'Université de Rennes

1985-1986: Assistant à l'Université de Rennes I

1983-1984: Professeur au Lycée Lyautey à Casablanca (Maroc).

THEMES DE RECHERCHE :

 Biologiste de formation, j’ai consacré l’essentiel de mes recherches à comprendre le métabolisme des plantes (Soja, Maïs, Tomate, Melon, etc.) et des microorganismes (Hebeloma mossea, Bradyrhizobium japonicum, etc). Aujourd’hui au sein de l’UMR Biologie du Fruit et Pathologie, nous essayons de développer des approches de biologie des systèmes pour comprendre le développement des fruits charnus en utilisant la tomate comme modèle des fruits charnus. L’objectif finalisé de notre recherche est de mieux comprendre la biologie du fruit et de fournir des connaissances pour améliorer la qualité du fruit et le rendement. Les outils de la génomique fonctionnelle comme la métabolomique et la fluxomique nous permettent d’explorer la complexité des réseaux métaboliques et d’en étudier leur régulation. La qualité du fruit et le rendement dépendent fortement des caractéristiques du métabolisme carboné, nos efforts portent actuellement sur l’étude de la plasticité et/ou l'élasticité du métabolisme au cours du développement des fruits soumis aux contraintes de l’environnement.

PUBLICATIONS :

2011

- H. Ferry-Dumazet, L. Gil, C. Deborde, A. Moing, S. Bernillon, D. Rolin, M. Nikolski, A. de Daruvar and D. Jacob (2011) MeRy-B: a web knowledgebase for the storage, visualization, analysis and annotation of plant NMR metabolomic profiles. BMC Plant Biology 11:104

 - E. Allen, A. Moing, J. Wattis, T. Larson, M. Maucourt, I. Graham, D. Rolin, M. Hooks (2011) Evidence that ACETATE NON-UTILIZING 1 prevents carbon leakage from peroxisomes during lipid mobilization in Arabidopsis seedlings Biochemical Journal 437, 505-513.

- Neily MH, Matsukura C, Maucourt M, Bernillon S, Deborde C, Moing A, Yin Y, Saito T, Mori K, Asamizu E, Rolin D, Moriguchi T, Ezura H (2010) Enhanced polyamine accumulation alters carotenoid metabolism at the transcriptional level in tomato fruit over-expressing spermidine synthase. Journal of Plant Physiology 168: 242-252.

- A. Moing, A. Aharoni, B. Biais, I. Rogachev, S. Meir, L. Brodsky, W. Allwood, A. Erban, W. Dunn, L. Kay, S. Koning, R. de Vos, H. Jonker, R. Mumm, C. Deborde, M. Maucourt, S. Bernillon, Y. Gibon, T. Hansen, S. Husted, R. Goodacre, J. Kopka, J. Schjoerring, D. Rolin and R. Hall (2011) Extensive metabolic cross-talk in melon fruit revealed byspatial and developmental combinatorial metabolomics. New Phytologist 190: 683-696.

2010

Allen E, Moing A, Ebbels TMD, Maucourt M, Tomos AD, Rolin D, Hooks M (2010). Correlation Network Analysis reveals a sequential reorganization of metabolic and transcriptional states during germination and gene-metabolite relationships in developing seedlings of Arabidopsis. BMC Systems Biology 4: 62.

Biais B, Beauvoit B, William Allwood J, Deborde C, Maucourt M, Goodacre R, Rolin D, Moing A. (2010). Metabolic acclimation to hypoxia revealed by metabolite gradients in melon fruit. J. Plant Physiol. 167: 242-245.

Champagne A, Bernillon S, Moing A, Rolin D, Legendre L, Lebot V (2010). Carotenoid profiling of tropical root crop chemotypes from Vanuatu, South Pacific. Journal of Food Composition and Analysis: 23: 763-771.

Horchani F., Stammitti-Bert LO., Baldet P., Cabasson C., Brouquisse R.,., Rolin D., Aschi-Smiti S., Raymond P. and Gallusci P.(2010) Effect of prolonged root hypoxia on the antioxydant content of tomato fruit. Plant Sciences 179: 209–218

How Kit A., Boureau L., Stammitti-Bert L., Rolin D., Teyssier E. and Gallusci P. (2010) Functional analysis of SlEZ1 a tomato Enhancer of zeste (E(z)) gene demonstrates a role in flower development. Plant Molecular Biology 74:201-213.

Ward J., Baker J.M., Miller S., Deborde C., Maucourt M., Biais B., Rolin D., Moing A., Moco S., Vervoort J., Lommen A., Schäfer H., Humpfer E., Beale M.H. (2010) An inter-laboratory comparison demonstrates that [1H]-NMR metabolite fingerprinting is a robust technique for collaborative plant metabolomic data collection. Metabolomics, 6: 263-273.