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UMR 1332 - Biologie du Fruit et Pathologie

UMR 1332 Biologie du Fruit et Pathologie

Catherine Deborde (Dr)

Ingénieur de Recherche en Résonance Magnétique Nucléaire appliquée à l’étude du métabolome

Formation / Diplôme:

1989 DUT Chimie. IUT de Poitiers.

1993 Ingénieur Chimiste de l’Ecole des Hautes études des Industries Chimiques de Strasbourg (ENSC EHICS)

1994 DEA Physico-Chimie et Qualité des Bio-Produits. Université de Nantes

1998 Doctorat ENSAR, mention Biochimie, Biologie Moléculaire & Cellulaire. ENSA de Rennes

Contact:

Tél. 05 57 12 25 30 / 25 78

catherine.deborde"at"inra.fr

Accès à la notice bibliographique complète "Articles, Chapitres d’ouvrage, Communications" (ProdINRA, la base des publications de l'INRA)

Sélection de Publications

UMR

Allwood JW, de Vos CHR, Moing A, Deborde C, Erban A, Kopka J, Goodacre R, Hall R (2011) Plant metabolomics and its potential for systems biology research: background concepts, technology and methodology. In D Jameson, M Verma, HV Westerhoff, eds, Methods In Systems Biology, Vol 500. Academic Press, Amsterdam, Netherlands, pp 299-336. DOI: 10.1016/B978-0-12-385118-5.00016-5

Benard C, Bernillon S, Biais B, Osorio S, Maucourt M, Ballias P, Deborde C, Colombié S, Cabasson C, Jacob D, Vercambre G, Gautier H, Rolin D, Génard M, Fernie AR, Gibon Y, Moing A (2015). Metabolomic profiling in tomato reveals diel compositional changes in fruit affected by source-sink relationships. Journal of Experimental Botany 66:3391-404. DOI : 10.1093/jxb/erv151

Bernillon S, Biais B, Deborde C, Maucourt M, Cabasson C, Gibon Y, Hansen TH, Husted S, de Vos CH, Mumm R, Jonker H, Ward JL, Miller SJ, Baker JM, Burger J, Tadmor Y, Beale MH, Schjoerring JK, Schäffer AA, Rolin D, Hall RD, Moing A (2013) Metabolomic and elemental profiling of melon fruit quality as affected by genotype and environment. Metabolomics 9: 57-77. DOI: 10.1007/s11306-012-0429-1

Moing A, Aharoni A, Biais B, Rogachev I, Meir S, Brodsky L, Allwood JW, Erban A, Dunn WB, Kay L, de Koning S, de Vos CHR, Jonker H, Mumm R, Deborde C, Maucourt M, Bernillon S, Gibon Y, Hansen TH, Husted S, Goodacre R, Kopka J, Schjoerring JK, Rolin D, Hall R (2011) Extensive metabolic cross talk in melon fruit revealed by spatial and developmental combinatorial metabolomics. New Phytologist 190: 683-696

PMB

Bornet A, Maucourt M, Deborde C, Jacob D, Milani J, Vuichoud B, Ji X, Dumez J-N, Moing A, Bodenhausen G, Jannin S, Giraudeau P (2016). Highly Repeatable Dissolution Dynamic Nuclear Polarization for Heteronuclear NMR Metabolomics. Analytical chemistry 88: 6179-83. DOI : 10.1021/acs.analchem.6b01094

Botton A, Rasori A, Ziliotto F, Moing A, Maucourt M, Bernillon S, Deborde C, Petterle A, Varotto S, Bonghi C (2016). The peach HECATE3-like gene FLESHY plays a double role during fruit development. Plant Molecular Biology 91: 97-114. DOI : 10.1007/s11103-016-0445-z

Deborde C, Jacob D (2014) Exploring plant primary metabolism with MeRy-B a metabolomic database and knowledge base dedicated to plant. In G Sriram, ed, Plant Metabolism: Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology, Humana Press, vol 1083, pp3-16.  DOI 10.1007/978-1-62703-661-0_1

Dumez J-N, Milani J, Vuichoud B, Bornet A, Lalande-Martin J, Tea I, Yon M, Maucourt M, Deborde C, Moing A, Frydman L, Bodenhausen G, Jannin S, Giraudeau P (2015). Hyperpolarized NMR of plant and cancer cell extracts at natural abundance. Analyst, 140 : 5860-3. DOI : 10.1039/c5an01203a

Ferry-Dumazet H, Gil L, Deborde C, Moing A, Bernillon S, Rolin D, Nikolski M, de Daruvar A, Jacob D (2011) MeRy-B: a web knowledgebase for the storage, visualization, analysis and annotation of plant 1H-NMR metabolomic profiles. BMC Plant Biology 11: 104-126

Jacob D, Deborde C, Lefebvre M, Maucourt M, Moing A (2017). NMRProcFlow: a graphical and interactive tool dedicated to 1D spectra processing for NMR-based metabolomics. Metabolomics, 13: 36. DOI : 10.1007/s11306-017-1178-y

Jacob D, Deborde C, Moing A (2013) An efficient spectra processing method for metabolite identification from 1H-NMR metabolomics data. Analytical and Bioanalytical Chemistry 405: 5049-5061. DOI: 10.1007/s00216-013-6852-y

Salek R, Neumann S, Schober D, Hummel J, Billiau K, Kopka J, Correa E, Reijmers T, Rosato A, Tenori L, Turano P, Marin S, Deborde C, Jacob D, Rolin D, Dartigues B, Conesa P, Haug K, Rocca-Serra P, O’Hagan S, Hao J, Vliet Mv, Sysi-Aho M, Ludwig C, Bouwman J, Cascante M, Ebbels T, Griffin JL, Moing A, Nikolski M, Oresic M, Sansone SA, Viant MR, Goodacre R, Günther UL, Hankemeier T, Luchinat C, Walther D, Steinbeck C (2015). COordination of Standards in MetabOlomicS (COSMOS): facilitating integrated metabolomics data access. Metabolomics 11:1587-1597. DOI : 10.1007/s11306-015-0810-y

 

Informations complémentaires:

Animation et communication scientifique du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique (www.rfmf.fr) de 2005 à 2015.

« Activities in France » In « Metabolomics across the globe » Metabolomics 2013, 9 :258-264

Base de données et de connaissances sur la métabolomique des plantes : Metabolomics Repository Bordeaux MeRy-B

Jacob D, Deborde C (2012) MeRy-B: a plant metabolomics database and knowledgebase. www.metabonews.ca/Mar2012/MetaboNews_Mar2012.htm