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UMR 1332 - Biologie du Fruit et Pathologie

UMR 1332 Biologie du Fruit et Pathologie

Cécile Cabasson (Dr)

Cécile Cabasson
Enseignante-Chercheure

Membre de la Plateforme Métabolome-Fluxome CGFB (Statistique)
Correspondante Université numérique Bordeaux 4

CV : 

Diplômes : Doctorat de Physiologie    

Parcours : De la physiologie végétale à l’analyse de données multivariées

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CONTACTS : 

Recherche

Tel 33(0)557122556 - Fax 33(0)557122541

Cecile.Cabasson@bordeaux.inra.fr

Enseignement

Tel 33(0)553025874 - Fax 33(0)553025884

THEMES DE RECHERCHE :

Biologie du fruit – Métabolisme

Etude de la réorganisation du métabolisme du fruit suite à une modification génétique ou à un stress abiotique.

1) Plantes transgéniques sous-exprimant le gène codant pour la PEP Carboxylase spécifique du fruit, enzyme impliquée dans la synthèse de malate, acide organique majeur dans le fruit de tomate au moment de la phase de croissance par grandissement cellulaire.

2) Plantes soumises à un stress cadmique (collaboration Université de Tunis)

3) Plantes soumises à une hypoxie (collaboration Université de Tunis)

4) Plantes soumises à un stress hydrique (projet FRIM)

5) Plante soumises à un stress carboné (projet FRIM).

Méthodologie : Métabolomique par RMN du proton

Identification et quantification des petites molécules contenues dans les tissus ou les fruits.

- Echantillonnage de tissus végétatifs, fruits ou tissus de fruit

- Extraction des métabolites

- Analyse biochimique des métabolites

- Prétraitement des données spectrales

- Analyse statistique exploratoire des données métabolomiques

PROJETS:

STREP META-PHOR - Metabolomics for plants, health and outreach (2006-2009)

ERASYSBIO+ FRIM – Fruit integrative Modelling (2010-2012)

METABOHUB WP1 – Metabolomics (2013-2019) http://www.metabohub.fr/
Multisite implementation of analytical chemistry for metabolite detection, quantification and identification

Illustration 1
Illustration 2

PUBLICATIONS :

Publications dans la base des publications de l'INRA ProdINRA

View publications on GoogleScholar

2013

Rolin, D. ; Deborde, C. ; Maucourt, M. ; Cabasson, C. ; Fauvelle, F. ; Jacob, D. ; Canlet, C. ; Moing, A. High-resolution 1H-NMR spectroscopy and beyond to explore plant metabolome. In : Dominique Rolin, Metabolomics Coming of Age with its Technological Diversity. Londres (GBR) : Academic Press - Elsevier (Advances in Botanical Research, 67, 1ère éd.). pp1-66. DOI10.1016/B978-0-12-397922-3.00001-0

2012

Ben Akal-Ben Fatma, Y. ; Pianelli, K. ; Dieuaide Noubhani, M. ; Le menn, A. ; Deborde, C. ; Maucourt, M. ; Andrieu, M.-H. ; Rolin, D. ; Rothan, C. ; Moing, A. ; Bouzid, S. ; Cabasson, C. 1H-NMR metabolomics: Profiling method for a rapid and efficient screening of transgenic plants. African Journal of Biotechnology, 11 (52) : 11386-11399. DOI 0.5897/AJB12.08812.088  

2011

Biais B., Bernillon S., Deborde C., Cabasson C., Rolin D., Tadmor Y., Burger J., Schaffer A.A., Moing A. Precaution for harvest, sampling, storage and transport of crop plant metabolomics samples, in Plant Metabolomics (Hardy, N, Hall, R, eds), Humana Press, Totowa, U.S.A.

BenAkal – Ben Fatma Y., Pianelli K., Dieuaide-Noubhani M., Le Menn A., Deborde C., Maucourt M., Andrieu M.-H., Rolin D., Rothan C., Moing A., Bouzid S, Cabasson C., (2011) 1H-NMR metabolomics-proiling method for a rapid and efficient screening of transgenic plants. Comptes-rendus de l’Académie des Sciences – Biologie (soumis)

2010

Hédijii H., Djelabi W., Cabasson C., Maucourt M., Baldet P., Bertrand A., Boulila Zoghlami L., Deborde C., Moing A., Brouquisse R., Chaïbi W., Gallusci P. Effects of long-term cadmium exposure on growth and metabolomic profile of tomato plants. Ecophysiology and Environmental Safety 73(8): 1965 – 1974

Horchani F., Stammiti-Bert L.O., Baldet P., Cabasson C., Brouquisse R., Rolin D.? Aschi Smiti S., Raymon P., Gallusci P., Effect of prolonged root hypoxia on the ntioxydant content of tomato fruit. Plant Science 179: 209-218

2009

CabassonC., Bernillon S., Deborde C.. La métabolomique appliquée à l’étude de la physiologie de la tomate : démarche et perspectives. Spectra Analyse 271 : 26-31

BASES DE DONNEES

MeRy-B, a web-based application, mainly designed to store and analyse plant metabolome data obtained by GC-MS and 1H-NMR, developed by CBiB (Bioinformatic Center of Bordeaux) in collaboration with UMR 1332 Fruit Biology and Pathology.

http://biodatabase.org/index.php/MERYB

MEMOIRES ENCADRES

Y. Ben Akal-Ben Fatma. Etude du rôle de la phosphoenolcarboxylase dans le contrôle de la qualité du fruit de tomate. (Doctorat, Université de Tunis El Manar, Tunisie, 2013)

O. Harouna Koré. Influence du métabolisme primaire sur la synthèse des lipides dans les graines de tomate. (Master 2, Université de Bordeaux, 2011)

H. Hediji. Influence du cadmium sur la croissance et la reproduction de la tomate : aspects physiologiques, biochimiques et moléculaires. (Doctorat, Université de Tunis, 2011)

DOCUMENTS PEDAGOGIQUES

Biologie cellulaire – modules 1, 2, 3

http:///www.iutenligne.net/

 

INFORMATIONS COMPLEMENTAIRES :

IUT Génie Biologique – Périgueux Université de Bordeaux

http://www.perigueux.u-bordeaux4.fr/iut/

Réseau Français de Métabolomique et de Fluxomique

https://www.bordeaux.inra.fr/ifr103/reseau_metabolome/

Société française de Biologie végétale

https://sfbv.snv.jussieu.fr

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